Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hace1Q3U0D9 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hace1Q3U0D9 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hace1Q3U0D9 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hace1Q3U0D9 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hace1Q3U0D9 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hace1Q3U0D9 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hace1Q3U0D9 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hace1Q3U0D9 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hace1Q3U0D9 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hace1Q3U0D9 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hace1Q3U0D9 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hace1Q3U0D9 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Hace1Q3U0D9 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hace1Q3U0D9 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hace1Q3U0D9 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Hace1Q3U0D9 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hace1Q3U0D9 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Hace1Q3U0D9 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hace1Q3U0D9 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hace1Q3U0D9 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hace1Q3U0D9 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hace1Q3U0D9 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hace1Q3U0D9 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hace1Q3U0D9 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hace1Q3U0D9 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hace1Q3U0D9 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hace1Q3U0D9 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hace1Q3U0D9 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hace1Q3U0D9 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hace1Q3U0D9 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hace1Q3U0D9 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hace1Q3U0D9 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hace1Q3U0D9 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hace1Q3U0D9 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hace1Q3U0D9 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hace1Q3U0D9 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hace1Q3U0D9 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hace1Q3U0D9 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hace1Q3U0D9 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hace1Q3U0D9 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hace1Q3U0D9 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Hace1Q3U0D9 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hace1Q3U0D9 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hace1Q3U0D9 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hace1Q3U0D9 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hace1Q3U0D9 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hace1Q3U0D9 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hace1Q3U0D9 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hace1Q3U0D9 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hace1Q3U0D9 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hace1Q3U0D9 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hace1Q3U0D9 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hace1Q3U0D9 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hace1Q3U0D9 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hace1Q3U0D9 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hace1Q3U0D9 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Hace1Q3U0D9 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hace1Q3U0D9 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hace1Q3U0D9 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hace1Q3U0D9 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hace1Q3U0D9 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hace1Q3U0D9 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hace1Q3U0D9 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hace1Q3U0D9 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hace1Q3U0D9 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hace1Q3U0D9 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hace1Q3U0D9 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hace1Q3U0D9 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hace1Q3U0D9 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hace1Q3U0D9 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hace1Q3U0D9 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hace1Q3U0D9 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hace1Q3U0D9 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hace1Q3U0D9 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hace1Q3U0D9 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hace1Q3U0D9 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hace1Q3U0D9 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Hace1Q3U0D9 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Hace1Q3U0D9 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hace1Q3U0D9 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hace1Q3U0D9 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hace1Q3U0D9 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hace1Q3U0D9 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hace1Q3U0D9 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hace1Q3U0D9 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hace1Q3U0D9 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hace1Q3U0D9 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hace1Q3U0D9 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Hace1Q3U0D9 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hace1Q3U0D9 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hace1Q3U0D9 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hace1Q3U0D9 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Hace1Q3U0D9 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hace1Q3U0D9 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hace1Q3U0D9 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hace1Q3U0D9 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hace1Q3U0D9 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hace1Q3U0D9 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hace1Q3U0D9 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms