Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0A6

Hbq1b, Globin d1, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbq1bQ3U0A6 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hbq1bQ3U0A6 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hbq1bQ3U0A6 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hbq1bQ3U0A6 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hbq1bQ3U0A6 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hbq1bQ3U0A6 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hbq1bQ3U0A6 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hbq1bQ3U0A6 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hbq1bQ3U0A6 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hbq1bQ3U0A6 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Hbq1bQ3U0A6 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hbq1bQ3U0A6 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hbq1bQ3U0A6 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hbq1bQ3U0A6 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hbq1bQ3U0A6 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hbq1bQ3U0A6 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hbq1bQ3U0A6 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hbq1bQ3U0A6 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hbq1bQ3U0A6 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hbq1bQ3U0A6 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hbq1bQ3U0A6 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hbq1bQ3U0A6 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hbq1bQ3U0A6 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hbq1bQ3U0A6 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hbq1bQ3U0A6 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hbq1bQ3U0A6 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hbq1bQ3U0A6 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hbq1bQ3U0A6 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hbq1bQ3U0A6 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hbq1bQ3U0A6 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hbq1bQ3U0A6 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hbq1bQ3U0A6 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hbq1bQ3U0A6 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hbq1bQ3U0A6 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hbq1bQ3U0A6 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hbq1bQ3U0A6 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hbq1bQ3U0A6 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Hbq1bQ3U0A6 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hbq1bQ3U0A6 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hbq1bQ3U0A6 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hbq1bQ3U0A6 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hbq1bQ3U0A6 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hbq1bQ3U0A6 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Hbq1bQ3U0A6 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hbq1bQ3U0A6 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Hbq1bQ3U0A6 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hbq1bQ3U0A6 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hbq1bQ3U0A6 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hbq1bQ3U0A6 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hbq1bQ3U0A6 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hbq1bQ3U0A6 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hbq1bQ3U0A6 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hbq1bQ3U0A6 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hbq1bQ3U0A6 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hbq1bQ3U0A6 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hbq1bQ3U0A6 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hbq1bQ3U0A6 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hbq1bQ3U0A6 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hbq1bQ3U0A6 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hbq1bQ3U0A6 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hbq1bQ3U0A6 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hbq1bQ3U0A6 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hbq1bQ3U0A6 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hbq1bQ3U0A6 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hbq1bQ3U0A6 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hbq1bQ3U0A6 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hbq1bQ3U0A6 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hbq1bQ3U0A6 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hbq1bQ3U0A6 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Hbq1bQ3U0A6 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hbq1bQ3U0A6 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hbq1bQ3U0A6 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hbq1bQ3U0A6 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Hbq1bQ3U0A6 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hbq1bQ3U0A6 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hbq1bQ3U0A6 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hbq1bQ3U0A6 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Hbq1bQ3U0A6 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hbq1bQ3U0A6 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hbq1bQ3U0A6 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hbq1bQ3U0A6 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hbq1bQ3U0A6 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hbq1bQ3U0A6 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hbq1bQ3U0A6 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hbq1bQ3U0A6 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hbq1bQ3U0A6 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hbq1bQ3U0A6 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hbq1bQ3U0A6 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hbq1bQ3U0A6 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hbq1bQ3U0A6 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hbq1bQ3U0A6 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hbq1bQ3U0A6 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hbq1bQ3U0A6 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hbq1bQ3U0A6 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hbq1bQ3U0A6 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hbq1bQ3U0A6 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hbq1bQ3U0A6 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hbq1bQ3U0A6 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hbq1bQ3U0A6 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hbq1bQ3U0A6 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.5 ms