Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctdnep1Q3TP92 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Ctdnep1Q3TP92 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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