Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms