Protein–RNA interactions for Protein: Q24JP3

Fam178b, Protein FAM178B, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam178bQ24JP3 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam178bQ24JP3 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam178bQ24JP3 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam178bQ24JP3 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam178bQ24JP3 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam178bQ24JP3 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fam178bQ24JP3 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fam178bQ24JP3 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fam178bQ24JP3 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fam178bQ24JP3 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fam178bQ24JP3 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam178bQ24JP3 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam178bQ24JP3 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam178bQ24JP3 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam178bQ24JP3 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam178bQ24JP3 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam178bQ24JP3 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam178bQ24JP3 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam178bQ24JP3 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam178bQ24JP3 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam178bQ24JP3 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam178bQ24JP3 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam178bQ24JP3 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam178bQ24JP3 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam178bQ24JP3 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam178bQ24JP3 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam178bQ24JP3 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam178bQ24JP3 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam178bQ24JP3 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam178bQ24JP3 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam178bQ24JP3 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam178bQ24JP3 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam178bQ24JP3 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam178bQ24JP3 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam178bQ24JP3 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam178bQ24JP3 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam178bQ24JP3 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam178bQ24JP3 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam178bQ24JP3 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam178bQ24JP3 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam178bQ24JP3 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam178bQ24JP3 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam178bQ24JP3 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam178bQ24JP3 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam178bQ24JP3 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam178bQ24JP3 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam178bQ24JP3 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam178bQ24JP3 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam178bQ24JP3 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam178bQ24JP3 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam178bQ24JP3 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam178bQ24JP3 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam178bQ24JP3 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam178bQ24JP3 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam178bQ24JP3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam178bQ24JP3 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam178bQ24JP3 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam178bQ24JP3 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam178bQ24JP3 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam178bQ24JP3 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam178bQ24JP3 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam178bQ24JP3 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam178bQ24JP3 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam178bQ24JP3 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam178bQ24JP3 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam178bQ24JP3 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam178bQ24JP3 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam178bQ24JP3 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam178bQ24JP3 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam178bQ24JP3 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam178bQ24JP3 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam178bQ24JP3 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam178bQ24JP3 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam178bQ24JP3 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam178bQ24JP3 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam178bQ24JP3 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam178bQ24JP3 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam178bQ24JP3 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam178bQ24JP3 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam178bQ24JP3 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam178bQ24JP3 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam178bQ24JP3 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam178bQ24JP3 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam178bQ24JP3 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam178bQ24JP3 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam178bQ24JP3 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam178bQ24JP3 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam178bQ24JP3 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam178bQ24JP3 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam178bQ24JP3 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam178bQ24JP3 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam178bQ24JP3 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam178bQ24JP3 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam178bQ24JP3 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam178bQ24JP3 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam178bQ24JP3 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam178bQ24JP3 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam178bQ24JP3 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam178bQ24JP3 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam178bQ24JP3 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms