Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trim71Q1PSW8 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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