Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VgfQ0VGU4 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VgfQ0VGU4 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms