Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Itgb8Q0VBD0 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms