Protein–RNA interactions for Protein: Q0VB07

Pglyrp4, Peptidoglycan recognition protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pglyrp4Q0VB07 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Pglyrp4Q0VB07 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Pglyrp4Q0VB07 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Pglyrp4Q0VB07 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Pglyrp4Q0VB07 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Pglyrp4Q0VB07 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Pglyrp4Q0VB07 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Pglyrp4Q0VB07 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Pglyrp4Q0VB07 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Pglyrp4Q0VB07 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Pglyrp4Q0VB07 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Pglyrp4Q0VB07 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Pglyrp4Q0VB07 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Pglyrp4Q0VB07 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Pglyrp4Q0VB07 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Pglyrp4Q0VB07 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Pglyrp4Q0VB07 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Pglyrp4Q0VB07 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Pglyrp4Q0VB07 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pglyrp4Q0VB07 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pglyrp4Q0VB07 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pglyrp4Q0VB07 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pglyrp4Q0VB07 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pglyrp4Q0VB07 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pglyrp4Q0VB07 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pglyrp4Q0VB07 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pglyrp4Q0VB07 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pglyrp4Q0VB07 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pglyrp4Q0VB07 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pglyrp4Q0VB07 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pglyrp4Q0VB07 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pglyrp4Q0VB07 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pglyrp4Q0VB07 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pglyrp4Q0VB07 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pglyrp4Q0VB07 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pglyrp4Q0VB07 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pglyrp4Q0VB07 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pglyrp4Q0VB07 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pglyrp4Q0VB07 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pglyrp4Q0VB07 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Pglyrp4Q0VB07 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pglyrp4Q0VB07 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pglyrp4Q0VB07 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pglyrp4Q0VB07 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Pglyrp4Q0VB07 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pglyrp4Q0VB07 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pglyrp4Q0VB07 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pglyrp4Q0VB07 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pglyrp4Q0VB07 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pglyrp4Q0VB07 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pglyrp4Q0VB07 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pglyrp4Q0VB07 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pglyrp4Q0VB07 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pglyrp4Q0VB07 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pglyrp4Q0VB07 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pglyrp4Q0VB07 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pglyrp4Q0VB07 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pglyrp4Q0VB07 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pglyrp4Q0VB07 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pglyrp4Q0VB07 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pglyrp4Q0VB07 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Pglyrp4Q0VB07 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Pglyrp4Q0VB07 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pglyrp4Q0VB07 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pglyrp4Q0VB07 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pglyrp4Q0VB07 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pglyrp4Q0VB07 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pglyrp4Q0VB07 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pglyrp4Q0VB07 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pglyrp4Q0VB07 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pglyrp4Q0VB07 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pglyrp4Q0VB07 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pglyrp4Q0VB07 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Pglyrp4Q0VB07 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Pglyrp4Q0VB07 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Pglyrp4Q0VB07 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Pglyrp4Q0VB07 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Pglyrp4Q0VB07 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Pglyrp4Q0VB07 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Pglyrp4Q0VB07 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Pglyrp4Q0VB07 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Pglyrp4Q0VB07 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Pglyrp4Q0VB07 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Pglyrp4Q0VB07 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Pglyrp4Q0VB07 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Pglyrp4Q0VB07 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Pglyrp4Q0VB07 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Pglyrp4Q0VB07 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Pglyrp4Q0VB07 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Pglyrp4Q0VB07 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Pglyrp4Q0VB07 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Pglyrp4Q0VB07 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Pglyrp4Q0VB07 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Pglyrp4Q0VB07 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Pglyrp4Q0VB07 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Pglyrp4Q0VB07 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Pglyrp4Q0VB07 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Pglyrp4Q0VB07 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Pglyrp4Q0VB07 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Pglyrp4Q0VB07 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms