Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Spata18Q0P557 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms