Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TrioQ0KL02 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TrioQ0KL02 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TrioQ0KL02 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TrioQ0KL02 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TrioQ0KL02 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TrioQ0KL02 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TrioQ0KL02 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TrioQ0KL02 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TrioQ0KL02 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TrioQ0KL02 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TrioQ0KL02 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TrioQ0KL02 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TrioQ0KL02 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TrioQ0KL02 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TrioQ0KL02 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TrioQ0KL02 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
TrioQ0KL02 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TrioQ0KL02 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TrioQ0KL02 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TrioQ0KL02 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TrioQ0KL02 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TrioQ0KL02 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TrioQ0KL02 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TrioQ0KL02 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TrioQ0KL02 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TrioQ0KL02 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
TrioQ0KL02 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.2
TrioQ0KL02 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
TrioQ0KL02 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
TrioQ0KL02 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
TrioQ0KL02 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.2
TrioQ0KL02 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms