Protein–RNA interactions for Protein: Q08652

Rbp2, Retinol-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp2Q08652 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbp2Q08652 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms