Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kcnma1Q08460 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms