Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gata4Q08369 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms