Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cnn1Q08091 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms