Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
AmbpQ07456 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms