Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms