Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Apoc2Q05020 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms