Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Msx2Q03358 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms