Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

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Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Mmp11Q02853 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Mmp11Q02853 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Mmp11Q02853 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Mmp11Q02853 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Mmp11Q02853 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Mmp11Q02853 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mmp11Q02853 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Mmp11Q02853 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Mmp11Q02853 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mmp11Q02853 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mmp11Q02853 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mmp11Q02853 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Mmp11Q02853 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Mmp11Q02853 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Mmp11Q02853 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Mmp11Q02853 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mmp11Q02853 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mmp11Q02853 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mmp11Q02853 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mmp11Q02853 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Mmp11Q02853 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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