Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NfiaQ02780 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms