Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HmgcrQ01237 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HmgcrQ01237 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HmgcrQ01237 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HmgcrQ01237 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HmgcrQ01237 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HmgcrQ01237 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HmgcrQ01237 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HmgcrQ01237 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HmgcrQ01237 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HmgcrQ01237 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HmgcrQ01237 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HmgcrQ01237 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HmgcrQ01237 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HmgcrQ01237 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HmgcrQ01237 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HmgcrQ01237 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HmgcrQ01237 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HmgcrQ01237 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HmgcrQ01237 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HmgcrQ01237 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HmgcrQ01237 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HmgcrQ01237 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HmgcrQ01237 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HmgcrQ01237 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HmgcrQ01237 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HmgcrQ01237 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HmgcrQ01237 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HmgcrQ01237 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HmgcrQ01237 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HmgcrQ01237 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HmgcrQ01237 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HmgcrQ01237 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HmgcrQ01237 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HmgcrQ01237 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HmgcrQ01237 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HmgcrQ01237 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HmgcrQ01237 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HmgcrQ01237 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HmgcrQ01237 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HmgcrQ01237 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HmgcrQ01237 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HmgcrQ01237 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HmgcrQ01237 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HmgcrQ01237 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HmgcrQ01237 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
HmgcrQ01237 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HmgcrQ01237 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HmgcrQ01237 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HmgcrQ01237 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HmgcrQ01237 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HmgcrQ01237 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HmgcrQ01237 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HmgcrQ01237 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HmgcrQ01237 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HmgcrQ01237 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HmgcrQ01237 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HmgcrQ01237 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HmgcrQ01237 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HmgcrQ01237 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HmgcrQ01237 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HmgcrQ01237 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HmgcrQ01237 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HmgcrQ01237 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HmgcrQ01237 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HmgcrQ01237 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HmgcrQ01237 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HmgcrQ01237 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HmgcrQ01237 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HmgcrQ01237 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HmgcrQ01237 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HmgcrQ01237 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HmgcrQ01237 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HmgcrQ01237 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HmgcrQ01237 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HmgcrQ01237 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HmgcrQ01237 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
HmgcrQ01237 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
HmgcrQ01237 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HmgcrQ01237 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HmgcrQ01237 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HmgcrQ01237 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HmgcrQ01237 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HmgcrQ01237 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HmgcrQ01237 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HmgcrQ01237 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HmgcrQ01237 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HmgcrQ01237 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HmgcrQ01237 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HmgcrQ01237 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HmgcrQ01237 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
HmgcrQ01237 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HmgcrQ01237 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HmgcrQ01237 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HmgcrQ01237 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HmgcrQ01237 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HmgcrQ01237 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HmgcrQ01237 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HmgcrQ01237 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HmgcrQ01237 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms