Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gjb2Q00977 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms