Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
F8a1Q00558 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
F8a1Q00558 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
F8a1Q00558 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
F8a1Q00558 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
F8a1Q00558 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
F8a1Q00558 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
F8a1Q00558 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
F8a1Q00558 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
F8a1Q00558 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
F8a1Q00558 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
F8a1Q00558 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
F8a1Q00558 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
F8a1Q00558 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
F8a1Q00558 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
F8a1Q00558 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
F8a1Q00558 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
F8a1Q00558 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
F8a1Q00558 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
F8a1Q00558 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
F8a1Q00558 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
F8a1Q00558 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
F8a1Q00558 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
F8a1Q00558 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
F8a1Q00558 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
F8a1Q00558 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
F8a1Q00558 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
F8a1Q00558 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
F8a1Q00558 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
F8a1Q00558 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
F8a1Q00558 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
F8a1Q00558 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
F8a1Q00558 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
F8a1Q00558 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
F8a1Q00558 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
F8a1Q00558 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
F8a1Q00558 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
F8a1Q00558 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
F8a1Q00558 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
F8a1Q00558 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
F8a1Q00558 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
F8a1Q00558 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
F8a1Q00558 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
F8a1Q00558 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
F8a1Q00558 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
F8a1Q00558 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
F8a1Q00558 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
F8a1Q00558 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
F8a1Q00558 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
F8a1Q00558 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
F8a1Q00558 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
F8a1Q00558 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
F8a1Q00558 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
F8a1Q00558 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
F8a1Q00558 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
F8a1Q00558 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
F8a1Q00558 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
F8a1Q00558 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
F8a1Q00558 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
F8a1Q00558 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
F8a1Q00558 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
F8a1Q00558 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
F8a1Q00558 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
F8a1Q00558 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
F8a1Q00558 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
F8a1Q00558 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
F8a1Q00558 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
F8a1Q00558 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
F8a1Q00558 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
F8a1Q00558 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
F8a1Q00558 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
F8a1Q00558 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
F8a1Q00558 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
F8a1Q00558 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
F8a1Q00558 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
F8a1Q00558 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
F8a1Q00558 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
F8a1Q00558 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
F8a1Q00558 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
F8a1Q00558 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
F8a1Q00558 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
F8a1Q00558 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
F8a1Q00558 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
F8a1Q00558 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
F8a1Q00558 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
F8a1Q00558 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
F8a1Q00558 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
F8a1Q00558 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
F8a1Q00558 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
F8a1Q00558 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
F8a1Q00558 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
F8a1Q00558 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
F8a1Q00558 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
F8a1Q00558 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
F8a1Q00558 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
F8a1Q00558 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
F8a1Q00558 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
F8a1Q00558 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
F8a1Q00558 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
F8a1Q00558 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms