Protein–RNA interactions for Protein: P97386

Lig3, DNA ligase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig3P97386 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lig3P97386 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lig3P97386 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Lig3P97386 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lig3P97386 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lig3P97386 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lig3P97386 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lig3P97386 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lig3P97386 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lig3P97386 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lig3P97386 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lig3P97386 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lig3P97386 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lig3P97386 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lig3P97386 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lig3P97386 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lig3P97386 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lig3P97386 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lig3P97386 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lig3P97386 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lig3P97386 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lig3P97386 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lig3P97386 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lig3P97386 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lig3P97386 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lig3P97386 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lig3P97386 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lig3P97386 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lig3P97386 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Lig3P97386 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lig3P97386 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lig3P97386 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lig3P97386 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Lig3P97386 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Lig3P97386 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lig3P97386 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lig3P97386 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lig3P97386 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lig3P97386 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lig3P97386 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lig3P97386 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lig3P97386 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lig3P97386 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lig3P97386 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lig3P97386 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lig3P97386 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lig3P97386 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lig3P97386 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lig3P97386 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lig3P97386 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lig3P97386 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lig3P97386 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lig3P97386 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lig3P97386 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lig3P97386 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lig3P97386 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lig3P97386 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lig3P97386 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lig3P97386 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lig3P97386 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lig3P97386 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lig3P97386 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lig3P97386 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lig3P97386 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lig3P97386 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lig3P97386 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lig3P97386 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lig3P97386 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lig3P97386 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lig3P97386 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lig3P97386 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lig3P97386 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lig3P97386 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lig3P97386 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Lig3P97386 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lig3P97386 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lig3P97386 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lig3P97386 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lig3P97386 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lig3P97386 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lig3P97386 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Lig3P97386 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
Lig3P97386 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lig3P97386 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Lig3P97386 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lig3P97386 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lig3P97386 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Lig3P97386 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Lig3P97386 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lig3P97386 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lig3P97386 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lig3P97386 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lig3P97386 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lig3P97386 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Lig3P97386 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lig3P97386 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lig3P97386 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Lig3P97386 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lig3P97386 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lig3P97386 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms