Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pkp1P97350 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkp1P97350 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms