Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cbx1P83917 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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