Protein–RNA interactions for Protein: P70387

Hfe, Hereditary hemochromatosis protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HfeP70387 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
HfeP70387 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HfeP70387 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
HfeP70387 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
HfeP70387 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
HfeP70387 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HfeP70387 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HfeP70387 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HfeP70387 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
HfeP70387 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HfeP70387 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
HfeP70387 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HfeP70387 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HfeP70387 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
HfeP70387 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HfeP70387 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HfeP70387 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
HfeP70387 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
HfeP70387 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
HfeP70387 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HfeP70387 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
HfeP70387 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HfeP70387 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HfeP70387 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HfeP70387 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HfeP70387 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
HfeP70387 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HfeP70387 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HfeP70387 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HfeP70387 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
HfeP70387 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HfeP70387 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HfeP70387 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HfeP70387 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HfeP70387 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HfeP70387 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HfeP70387 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HfeP70387 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HfeP70387 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HfeP70387 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HfeP70387 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HfeP70387 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HfeP70387 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
HfeP70387 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
HfeP70387 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HfeP70387 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
HfeP70387 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
HfeP70387 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HfeP70387 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HfeP70387 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HfeP70387 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HfeP70387 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HfeP70387 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HfeP70387 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HfeP70387 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HfeP70387 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HfeP70387 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HfeP70387 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HfeP70387 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HfeP70387 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HfeP70387 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HfeP70387 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HfeP70387 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HfeP70387 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HfeP70387 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HfeP70387 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HfeP70387 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HfeP70387 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HfeP70387 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HfeP70387 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HfeP70387 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HfeP70387 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
HfeP70387 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HfeP70387 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HfeP70387 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
HfeP70387 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HfeP70387 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HfeP70387 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
HfeP70387 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
HfeP70387 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HfeP70387 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HfeP70387 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
HfeP70387 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
HfeP70387 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HfeP70387 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
HfeP70387 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
HfeP70387 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
HfeP70387 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HfeP70387 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HfeP70387 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HfeP70387 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
HfeP70387 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HfeP70387 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HfeP70387 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HfeP70387 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HfeP70387 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HfeP70387 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HfeP70387 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HfeP70387 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HfeP70387 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms