Protein–RNA interactions for Protein: P62830

Rpl23, 60S ribosomal protein L23, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl23P62830 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl23P62830 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl23P62830 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl23P62830 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl23P62830 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl23P62830 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl23P62830 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl23P62830 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl23P62830 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl23P62830 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl23P62830 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl23P62830 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl23P62830 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl23P62830 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl23P62830 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl23P62830 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl23P62830 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl23P62830 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl23P62830 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl23P62830 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl23P62830 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl23P62830 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl23P62830 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl23P62830 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl23P62830 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl23P62830 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl23P62830 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl23P62830 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl23P62830 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl23P62830 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl23P62830 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl23P62830 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl23P62830 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl23P62830 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl23P62830 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl23P62830 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl23P62830 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl23P62830 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl23P62830 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl23P62830 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl23P62830 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl23P62830 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl23P62830 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl23P62830 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl23P62830 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl23P62830 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl23P62830 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl23P62830 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rpl23P62830 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rpl23P62830 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rpl23P62830 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rpl23P62830 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rpl23P62830 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rpl23P62830 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rpl23P62830 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rpl23P62830 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rpl23P62830 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl23P62830 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl23P62830 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl23P62830 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl23P62830 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl23P62830 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl23P62830 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl23P62830 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl23P62830 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl23P62830 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl23P62830 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl23P62830 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl23P62830 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl23P62830 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl23P62830 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl23P62830 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl23P62830 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl23P62830 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl23P62830 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl23P62830 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl23P62830 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl23P62830 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl23P62830 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl23P62830 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl23P62830 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl23P62830 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl23P62830 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl23P62830 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl23P62830 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl23P62830 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl23P62830 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl23P62830 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl23P62830 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl23P62830 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl23P62830 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl23P62830 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl23P62830 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl23P62830 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl23P62830 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl23P62830 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl23P62830 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl23P62830 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl23P62830 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl23P62830 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms