Protein–RNA interactions for Protein: P62754

Rps6, 40S ribosomal protein S6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6P62754 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps6P62754 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps6P62754 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps6P62754 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps6P62754 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps6P62754 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps6P62754 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps6P62754 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps6P62754 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps6P62754 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps6P62754 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps6P62754 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps6P62754 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps6P62754 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps6P62754 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps6P62754 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps6P62754 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps6P62754 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps6P62754 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps6P62754 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps6P62754 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps6P62754 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps6P62754 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps6P62754 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps6P62754 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps6P62754 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps6P62754 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps6P62754 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps6P62754 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps6P62754 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps6P62754 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps6P62754 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps6P62754 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps6P62754 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps6P62754 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps6P62754 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps6P62754 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps6P62754 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps6P62754 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps6P62754 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps6P62754 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps6P62754 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps6P62754 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps6P62754 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps6P62754 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps6P62754 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps6P62754 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps6P62754 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps6P62754 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps6P62754 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps6P62754 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps6P62754 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps6P62754 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps6P62754 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps6P62754 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps6P62754 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps6P62754 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps6P62754 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps6P62754 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps6P62754 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps6P62754 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps6P62754 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps6P62754 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps6P62754 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps6P62754 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps6P62754 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps6P62754 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps6P62754 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps6P62754 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps6P62754 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps6P62754 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps6P62754 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps6P62754 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps6P62754 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps6P62754 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps6P62754 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps6P62754 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps6P62754 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps6P62754 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps6P62754 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps6P62754 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps6P62754 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps6P62754 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps6P62754 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps6P62754 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps6P62754 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps6P62754 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps6P62754 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps6P62754 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps6P62754 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps6P62754 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps6P62754 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps6P62754 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps6P62754 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps6P62754 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps6P62754 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps6P62754 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps6P62754 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps6P62754 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps6P62754 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms