Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

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Length 85 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ufm1P61961 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ufm1P61961 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ufm1P61961 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ufm1P61961 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ufm1P61961 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ufm1P61961 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ufm1P61961 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Ufm1P61961 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ufm1P61961 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ufm1P61961 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ufm1P61961 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ufm1P61961 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ufm1P61961 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ufm1P61961 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ufm1P61961 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ufm1P61961 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ufm1P61961 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ufm1P61961 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ufm1P61961 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ufm1P61961 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ufm1P61961 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ufm1P61961 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ufm1P61961 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ufm1P61961 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ufm1P61961 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ufm1P61961 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ufm1P61961 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ufm1P61961 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ufm1P61961 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ufm1P61961 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ufm1P61961 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ufm1P61961 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ufm1P61961 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ufm1P61961 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ufm1P61961 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ufm1P61961 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ufm1P61961 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ufm1P61961 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ufm1P61961 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ufm1P61961 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ufm1P61961 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ufm1P61961 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ufm1P61961 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ufm1P61961 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ufm1P61961 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ufm1P61961 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ufm1P61961 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ufm1P61961 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ufm1P61961 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ufm1P61961 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ufm1P61961 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ufm1P61961 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ufm1P61961 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ufm1P61961 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ufm1P61961 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ufm1P61961 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ufm1P61961 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ufm1P61961 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ufm1P61961 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ufm1P61961 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ufm1P61961 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ufm1P61961 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ufm1P61961 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ufm1P61961 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms