Protein–RNA interactions for Protein: P59913

Pcmtd1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcmtd1P59913 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcmtd1P59913 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcmtd1P59913 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcmtd1P59913 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcmtd1P59913 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcmtd1P59913 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcmtd1P59913 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcmtd1P59913 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcmtd1P59913 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcmtd1P59913 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcmtd1P59913 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcmtd1P59913 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcmtd1P59913 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcmtd1P59913 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcmtd1P59913 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcmtd1P59913 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcmtd1P59913 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcmtd1P59913 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcmtd1P59913 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcmtd1P59913 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcmtd1P59913 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcmtd1P59913 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcmtd1P59913 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcmtd1P59913 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcmtd1P59913 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcmtd1P59913 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcmtd1P59913 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcmtd1P59913 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcmtd1P59913 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcmtd1P59913 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcmtd1P59913 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcmtd1P59913 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcmtd1P59913 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcmtd1P59913 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcmtd1P59913 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcmtd1P59913 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcmtd1P59913 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcmtd1P59913 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcmtd1P59913 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcmtd1P59913 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcmtd1P59913 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcmtd1P59913 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcmtd1P59913 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcmtd1P59913 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcmtd1P59913 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcmtd1P59913 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcmtd1P59913 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcmtd1P59913 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcmtd1P59913 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcmtd1P59913 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcmtd1P59913 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcmtd1P59913 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcmtd1P59913 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcmtd1P59913 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcmtd1P59913 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcmtd1P59913 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcmtd1P59913 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcmtd1P59913 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcmtd1P59913 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcmtd1P59913 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcmtd1P59913 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcmtd1P59913 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcmtd1P59913 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcmtd1P59913 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcmtd1P59913 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcmtd1P59913 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcmtd1P59913 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcmtd1P59913 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcmtd1P59913 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcmtd1P59913 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcmtd1P59913 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcmtd1P59913 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcmtd1P59913 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcmtd1P59913 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcmtd1P59913 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcmtd1P59913 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcmtd1P59913 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcmtd1P59913 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcmtd1P59913 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcmtd1P59913 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcmtd1P59913 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcmtd1P59913 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcmtd1P59913 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcmtd1P59913 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcmtd1P59913 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcmtd1P59913 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcmtd1P59913 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcmtd1P59913 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pcmtd1P59913 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pcmtd1P59913 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcmtd1P59913 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcmtd1P59913 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcmtd1P59913 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcmtd1P59913 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcmtd1P59913 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcmtd1P59913 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcmtd1P59913 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcmtd1P59913 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcmtd1P59913 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcmtd1P59913 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms