Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Nphp4P59240 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nphp4P59240 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nphp4P59240 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nphp4P59240 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nphp4P59240 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nphp4P59240 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nphp4P59240 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Nphp4P59240 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nphp4P59240 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nphp4P59240 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nphp4P59240 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nphp4P59240 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nphp4P59240 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Nphp4P59240 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nphp4P59240 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nphp4P59240 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Nphp4P59240 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nphp4P59240 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Nphp4P59240 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Nphp4P59240 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nphp4P59240 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nphp4P59240 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Nphp4P59240 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nphp4P59240 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nphp4P59240 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nphp4P59240 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nphp4P59240 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nphp4P59240 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nphp4P59240 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nphp4P59240 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nphp4P59240 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nphp4P59240 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nphp4P59240 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nphp4P59240 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nphp4P59240 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nphp4P59240 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Nphp4P59240 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nphp4P59240 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nphp4P59240 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nphp4P59240 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nphp4P59240 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nphp4P59240 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nphp4P59240 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nphp4P59240 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nphp4P59240 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nphp4P59240 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nphp4P59240 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nphp4P59240 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nphp4P59240 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nphp4P59240 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nphp4P59240 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nphp4P59240 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nphp4P59240 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nphp4P59240 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nphp4P59240 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nphp4P59240 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nphp4P59240 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nphp4P59240 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nphp4P59240 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nphp4P59240 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nphp4P59240 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nphp4P59240 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nphp4P59240 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nphp4P59240 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nphp4P59240 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nphp4P59240 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nphp4P59240 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nphp4P59240 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nphp4P59240 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nphp4P59240 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nphp4P59240 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nphp4P59240 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nphp4P59240 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nphp4P59240 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nphp4P59240 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nphp4P59240 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nphp4P59240 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nphp4P59240 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nphp4P59240 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nphp4P59240 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nphp4P59240 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nphp4P59240 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nphp4P59240 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nphp4P59240 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nphp4P59240 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nphp4P59240 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nphp4P59240 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nphp4P59240 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nphp4P59240 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nphp4P59240 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nphp4P59240 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nphp4P59240 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nphp4P59240 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nphp4P59240 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nphp4P59240 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nphp4P59240 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nphp4P59240 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nphp4P59240 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nphp4P59240 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms