Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
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P58686 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P58686 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P58686 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P58686 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P58686 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P58686 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P58686 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P58686 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
P58686 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P58686 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P58686 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P58686 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P58686 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P58686 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P58686 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P58686 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P58686 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P58686 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P58686 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P58686 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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P58686 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P58686 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
P58686 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
P58686 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
P58686 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
P58686 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P58686 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
P58686 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
P58686 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P58686 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P58686 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P58686 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P58686 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P58686 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P58686 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P58686 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P58686 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P58686 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P58686 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
P58686 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P58686 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P58686 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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P58686 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
P58686 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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P58686 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
P58686 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
P58686 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
P58686 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P58686 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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P58686 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P58686 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
P58686 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P58686 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
P58686 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P58686 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P58686 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P58686 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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P58686 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P58686 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P58686 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P58686 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
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P58686 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P58686 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P58686 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P58686 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P58686 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P58686 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P58686 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
P58686 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P58686 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P58686 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P58686 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
P58686 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P58686 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
P58686 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
P58686 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P58686 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms