Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

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Length 378 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Dpf3P58269 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Dpf3P58269 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Dpf3P58269 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Dpf3P58269 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
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Dpf3P58269 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Dpf3P58269 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Dpf3P58269 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dpf3P58269 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Dpf3P58269 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Dpf3P58269 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Dpf3P58269 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Dpf3P58269 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Dpf3P58269 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Dpf3P58269 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Dpf3P58269 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dpf3P58269 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dpf3P58269 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dpf3P58269 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dpf3P58269 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dpf3P58269 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dpf3P58269 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dpf3P58269 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dpf3P58269 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms