Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NcstnP57716 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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NcstnP57716 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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NcstnP57716 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
NcstnP57716 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NcstnP57716 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NcstnP57716 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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NcstnP57716 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NcstnP57716 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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NcstnP57716 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NcstnP57716 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
NcstnP57716 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
NcstnP57716 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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