Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp25P57080 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp25P57080 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp25P57080 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp25P57080 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp25P57080 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Usp25P57080 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Usp25P57080 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp25P57080 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp25P57080 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp25P57080 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms