Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Irf5P56477 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Irf5P56477 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irf5P56477 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irf5P56477 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irf5P56477 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irf5P56477 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irf5P56477 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irf5P56477 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irf5P56477 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Irf5P56477 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irf5P56477 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irf5P56477 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Irf5P56477 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms