Protein–RNA interactions for Protein: P56213

Gfer, FAD-linked sulfhydryl oxidase ALR, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GferP56213 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
GferP56213 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
GferP56213 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
GferP56213 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
GferP56213 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
GferP56213 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
GferP56213 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
GferP56213 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
GferP56213 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
GferP56213 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
GferP56213 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
GferP56213 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
GferP56213 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
GferP56213 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
GferP56213 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
GferP56213 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
GferP56213 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
GferP56213 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
GferP56213 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
GferP56213 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
GferP56213 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
GferP56213 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
GferP56213 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
GferP56213 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
GferP56213 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
GferP56213 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
GferP56213 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
GferP56213 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
GferP56213 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
GferP56213 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
GferP56213 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
GferP56213 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
GferP56213 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
GferP56213 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
GferP56213 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
GferP56213 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
GferP56213 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
GferP56213 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
GferP56213 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
GferP56213 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
GferP56213 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
GferP56213 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
GferP56213 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
GferP56213 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
GferP56213 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
GferP56213 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
GferP56213 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
GferP56213 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
GferP56213 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
GferP56213 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
GferP56213 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
GferP56213 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
GferP56213 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
GferP56213 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
GferP56213 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
GferP56213 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
GferP56213 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
GferP56213 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
GferP56213 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
GferP56213 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
GferP56213 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
GferP56213 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
GferP56213 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
GferP56213 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
GferP56213 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
GferP56213 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
GferP56213 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
GferP56213 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
GferP56213 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
GferP56213 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
GferP56213 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
GferP56213 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
GferP56213 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
GferP56213 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
GferP56213 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
GferP56213 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
GferP56213 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
GferP56213 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
GferP56213 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
GferP56213 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
GferP56213 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
GferP56213 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
GferP56213 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
GferP56213 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
GferP56213 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
GferP56213 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
GferP56213 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
GferP56213 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
GferP56213 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
GferP56213 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
GferP56213 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
GferP56213 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
GferP56213 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
GferP56213 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
GferP56213 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
GferP56213 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
GferP56213 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
GferP56213 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
GferP56213 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
GferP56213 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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