Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sh3bp1P55194 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Sh3bp1P55194 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Sh3bp1P55194 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Sh3bp1P55194 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Sh3bp1P55194 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sh3bp1P55194 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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