Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacnb3P54285 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms