Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa6P50704 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa6P50704 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa6P50704 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa6P50704 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Defa6P50704 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Defa6P50704 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Defa6P50704 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Defa6P50704 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Defa6P50704 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defa6P50704 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defa6P50704 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Defa6P50704 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms