Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TspoP50637 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
TspoP50637 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TspoP50637 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TspoP50637 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TspoP50637 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TspoP50637 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
TspoP50637 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TspoP50637 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
TspoP50637 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TspoP50637 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TspoP50637 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TspoP50637 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TspoP50637 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TspoP50637 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TspoP50637 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TspoP50637 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TspoP50637 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TspoP50637 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TspoP50637 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TspoP50637 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TspoP50637 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TspoP50637 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TspoP50637 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TspoP50637 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TspoP50637 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TspoP50637 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TspoP50637 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TspoP50637 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TspoP50637 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TspoP50637 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TspoP50637 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TspoP50637 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TspoP50637 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TspoP50637 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
TspoP50637 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TspoP50637 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TspoP50637 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
TspoP50637 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TspoP50637 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TspoP50637 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
TspoP50637 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
TspoP50637 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TspoP50637 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TspoP50637 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TspoP50637 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TspoP50637 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TspoP50637 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TspoP50637 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TspoP50637 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TspoP50637 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TspoP50637 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TspoP50637 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TspoP50637 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TspoP50637 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TspoP50637 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TspoP50637 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TspoP50637 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TspoP50637 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TspoP50637 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TspoP50637 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
TspoP50637 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TspoP50637 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TspoP50637 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TspoP50637 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TspoP50637 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TspoP50637 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TspoP50637 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TspoP50637 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TspoP50637 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TspoP50637 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TspoP50637 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TspoP50637 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TspoP50637 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TspoP50637 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TspoP50637 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TspoP50637 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
TspoP50637 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TspoP50637 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TspoP50637 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
TspoP50637 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
TspoP50637 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TspoP50637 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TspoP50637 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TspoP50637 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TspoP50637 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TspoP50637 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TspoP50637 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TspoP50637 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TspoP50637 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TspoP50637 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TspoP50637 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TspoP50637 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TspoP50637 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TspoP50637 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TspoP50637 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TspoP50637 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TspoP50637 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TspoP50637 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TspoP50637 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms