Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmod1P49813 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmod1P49813 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms