Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtpreP49446 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtpreP49446 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtpreP49446 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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PtpreP49446 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PtpreP49446 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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