Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

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Length 691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Epb42P49222 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Epb42P49222 C130071C03Rik-203ENSMUST00000182788 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Epb42P49222 9530097N15Rik-201ENSMUST00000197819 1068 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Letm2-206ENSMUST00000210234 837 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Trdn-202ENSMUST00000217779 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Epb42P49222 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Ica1-202ENSMUST00000115518 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Gm15626-201ENSMUST00000117478 868 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Gm20834-202ENSMUST00000185576 1220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Irf2-209ENSMUST00000210218 535 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Hesx1-201ENSMUST00000035433 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Epb42P49222 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Gm13780-201ENSMUST00000150482 1187 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Gm17555-201ENSMUST00000164042 1113 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Epb42P49222 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms