Protein–RNA interactions for Protein: P48985

Atoh1, Protein atonal homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh1P48985 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Atoh1P48985 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Atoh1P48985 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atoh1P48985 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atoh1P48985 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Atoh1P48985 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atoh1P48985 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atoh1P48985 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atoh1P48985 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atoh1P48985 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atoh1P48985 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atoh1P48985 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atoh1P48985 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atoh1P48985 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Atoh1P48985 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Atoh1P48985 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atoh1P48985 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atoh1P48985 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atoh1P48985 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atoh1P48985 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atoh1P48985 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atoh1P48985 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atoh1P48985 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atoh1P48985 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atoh1P48985 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atoh1P48985 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms