Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tnni3P48787 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tnni3P48787 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnni3P48787 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnni3P48787 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tnni3P48787 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnni3P48787 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnni3P48787 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnni3P48787 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnni3P48787 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnni3P48787 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnni3P48787 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnni3P48787 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnni3P48787 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnni3P48787 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnni3P48787 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tnni3P48787 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnni3P48787 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tnni3P48787 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnni3P48787 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnni3P48787 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnni3P48787 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnni3P48787 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnni3P48787 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnni3P48787 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnni3P48787 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnni3P48787 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnni3P48787 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnni3P48787 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnni3P48787 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnni3P48787 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnni3P48787 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnni3P48787 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tnni3P48787 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnni3P48787 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnni3P48787 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnni3P48787 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnni3P48787 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnni3P48787 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnni3P48787 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnni3P48787 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnni3P48787 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnni3P48787 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnni3P48787 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnni3P48787 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnni3P48787 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnni3P48787 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnni3P48787 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnni3P48787 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnni3P48787 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnni3P48787 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnni3P48787 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnni3P48787 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnni3P48787 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnni3P48787 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tnni3P48787 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnni3P48787 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnni3P48787 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnni3P48787 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnni3P48787 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnni3P48787 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnni3P48787 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnni3P48787 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnni3P48787 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnni3P48787 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnni3P48787 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnni3P48787 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tnni3P48787 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tnni3P48787 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnni3P48787 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tnni3P48787 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tnni3P48787 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnni3P48787 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnni3P48787 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnni3P48787 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnni3P48787 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnni3P48787 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnni3P48787 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnni3P48787 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnni3P48787 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnni3P48787 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnni3P48787 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnni3P48787 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tnni3P48787 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnni3P48787 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnni3P48787 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnni3P48787 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnni3P48787 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tnni3P48787 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnni3P48787 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnni3P48787 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnni3P48787 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnni3P48787 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnni3P48787 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnni3P48787 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnni3P48787 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnni3P48787 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnni3P48787 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnni3P48787 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnni3P48787 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms