Protein–RNA interactions for Protein: P48772

Cox8b, Cytochrome c oxidase subunit 8B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox8bP48772 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cox8bP48772 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms