Protein–RNA interactions for Protein: P47963

Rpl13, 60S ribosomal protein L13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13P47963 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl13P47963 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl13P47963 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl13P47963 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl13P47963 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl13P47963 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl13P47963 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl13P47963 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl13P47963 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl13P47963 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl13P47963 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl13P47963 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl13P47963 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl13P47963 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl13P47963 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl13P47963 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl13P47963 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl13P47963 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl13P47963 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl13P47963 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl13P47963 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl13P47963 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl13P47963 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rpl13P47963 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rpl13P47963 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rpl13P47963 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rpl13P47963 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rpl13P47963 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rpl13P47963 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rpl13P47963 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rpl13P47963 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl13P47963 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl13P47963 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl13P47963 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl13P47963 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl13P47963 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rpl13P47963 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl13P47963 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl13P47963 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rpl13P47963 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl13P47963 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl13P47963 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl13P47963 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rpl13P47963 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rpl13P47963 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl13P47963 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl13P47963 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl13P47963 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl13P47963 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl13P47963 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl13P47963 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl13P47963 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl13P47963 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl13P47963 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl13P47963 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl13P47963 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl13P47963 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl13P47963 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl13P47963 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl13P47963 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl13P47963 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl13P47963 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl13P47963 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl13P47963 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl13P47963 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl13P47963 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl13P47963 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl13P47963 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rpl13P47963 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl13P47963 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl13P47963 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rpl13P47963 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl13P47963 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl13P47963 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rpl13P47963 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl13P47963 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl13P47963 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl13P47963 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl13P47963 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl13P47963 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl13P47963 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl13P47963 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl13P47963 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl13P47963 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rpl13P47963 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl13P47963 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl13P47963 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl13P47963 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl13P47963 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl13P47963 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl13P47963 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl13P47963 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl13P47963 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl13P47963 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl13P47963 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl13P47963 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl13P47963 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl13P47963 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl13P47963 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl13P47963 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms